Научная библиотека Минусинского регионального краеведческого музея им.Н.М. Мартьянова входит в число старейших библиотек Сибири.
Открыта как музейная библиотека в 1878 г.
Библиотека создавалась при участии частных собраний: Г.П.Сафьянова, И.Т.Савенкова, Н.М.Мартьянова. Поступала литература от частных лиц – от писателя А.В. Амфитеатрова более 1500 ед., от писателя Приклонского более 250 ед., от Ф.Я.Кона – около 50, от Курнатовского – 13 книг, Яковлева – 42 ед., от Кржижановского, Старкова, В.И.Ленина и др.
В последние годы в библиотеку поступили частные собрания – К.А.Липинской (б. 160 ед.) писателя В.Яна (б. 250 ед.). И самое большое поступление – это домашняя библиотека В.А.Ковалева (б. 10 тыс. ед.). В 2012 г. в музей была передана библиотека семьи А.А.и И.Е.Шадриных.
В собрании научной библиотеки музея находятся издания по истории Сибири, истории России - географии, этнографии, археологии, естествознанию, справочная литература и др.
Наиболее ценная часть библиотечного фонда – периодические издания Х1Х в. – нач. ХХ в., особенно сибирские газеты и журналы: «Амур», «Восточное обозрение», «Звезда Алтая», «Знамя революции», «Сибирская деревня», «Сибирь», Енисейские губернские ведомости» (с 1857 г.), «Енисей», «Красноярский рабочий» (с 1905 г.) и другие. А также газеты и журналы, выходившие в Минусинске – «Почта и телеграф» (первая газета, вышло несколько номеров в 1906 г.), «Минусинский край», «Минусинский листок», «Южная Сибирь», «Власть труда» (с 1922 г.), «Сибирский архив» (1913-1915 гг.) и другие. Есть редкие, раритетные издания XVII-XIX вв. Первоначальный фонд библиотеки - 512 томов, на сегодняшний момент собрание научной библиотеки составляет 127 тыс. ед. хр.
Библиотека получила широкую известность среди музеев, архивов, ученой общественности Сибири, России, Германии, Франции, Японии и др.
Библиотека является библиотекой закрытого типа.